Với manh mối duy nhất là một trái táo màu đen kì lạ và một cánh đồng xác chết phát sáng, cậu bé thiên tài - nhà khoa học Haiji-kun dấn thân vào lãnh địa của những kẻ được gọi là "thần" để tìm kiếm kí ức bị đánh cắp của mình